مستند داستانی تب مژگان رمان امنیتی و جذابی با موضوع بهائیت‌شناسی است که با گم‌شدن دختری 19 ساله به نام مژگان شروع می‌شود. داستان از وضعیت بد روحی او به دلیل فوت مادرش آغاز می‌شود. گروهی از بهائیان که نسبت به تحقیقات امنیتی پدر خانواده در زمینه بهائیت احساس خطر کرده‌اند. آنها با برنامه‌ریزی از پیش تعیین‌شده به خانه آن‌ها نفوذ می‌کنند، اول به واسطه ترور تدریجی مادر مژگان و سپس بی‌هوش‌کردن مژگان با یک ماده خاص، زمینه تب‌های طولانی و بیماری‌های جسمی و روحی او را فراهم می‌کنند و باعث می‌شوند او در دام دوستانی از فرقه انحرافی بهائیت را بیفتد، در حقیقت به واسطه مژگان و برادرش آرمان، آنها قصد آسیب‌رساندن به پدر خانواده را دارند.