کتاب تطهیر با جاری قرآن، مجموعه ای است از تفسیر تعدادی سوره های قرآن با روشی نوین که در 3 جلد، به چاپ رسیده است. در این مجموعه، مولف سعی کرده تا با توجه به نا رسایی و جوابگو نبودن روش های مجموعی و موضوعی و واژه ای در تفسیر قرآن، اعم از روش های جدید و قدیم و هم چنین ناقص بودن روش کار با قرآن با توجه به شان نزول و تاریخ نزول و با توجه به تفاسیر و اقوال و تداعی و معانی و جریان عمل، راه و روشی نو، در رابطه با کار قرآن و تفسیر آن، ارائه دهد. این روش، با توجه به 3 اصل: درک ضرورت و نیاز به قرآن، شناخت مواضع آیه ها و تلاوت آن ها در جایگاه خویش و جریان رویش انسان، نه جریان عمل، به مفردات و بررسی کلمه ها و جمله ها، به ترکیب و شروع و ختم آیه ها به روابط و بررسی ارتباط آیات با همدیگر، به فضای آیات و جایگاه آن ها، توجه دارد. کتاب تطهیر با جاری قرآن - جلد دوم، به تفسیر سوره بقره اختصاص دارد. این کتاب نوشته استاد علی صفایی حائری (عین.صاد) است