ریشه زعفران همان خواص زعفران را -هر چند به مقدار کمتر- دارد و میتوان در مواقعی که رنگدهی زعفران مدنظر نیست و تنها خواص درمانی زعفران مورد توجه است از آن استفاده کرد. استفاده به جای زعفران در اینگونه مواقع صرفه ی اقتصادی نیز دارد. چرا که ریشه زعفران نسبت به زعفران نگین با قیمت کمتری عرضه می شود. در تهیه غذاهایی که فقط طعم و عطر زعفران ملاک است از قبیل ته دیگ، شیرینی، سوپ، خورشت، شربت و دمنوش هایی که مواد رنگی دیگری اضافه می کنیم، می توان از ریشه زعفران استفاده کرد. علاوه بر کاربرد های درمانیِ به صرفه ی ریشه زعفران، از آن در صنایع مختلف از جمله داروسازی، شکلات سازی و آرایشی و بهداشتی استفاده می شود.