پرسش‌گری و آزاد اندیشی در گفت‌وگو با اساتید حوزه حسین ایزدی در سنت علمی حوزه، همواره طلبه به «پرسشگری» تشویق می‌شود. دعوت طلبه به تأمل در مطالب و اشکال به آنها یعنی دعوت به پرسشگری، به همین دلیل، روح پرسشگری همواره در حوزه‌ها جاری بوده است. اگر در جامعه علمی پرسشگری رونق داشته باشد و به یک ارزش عمومی تبدیل شود، در حقیقت آن جامعه به مقام پاسداشت دانستن و فهمیدن رسیده است. چنین جامعه‌ای راه نزدیک‌تری به قله‌های دانش دارد. پرسشگری زمینه ساز تقویت اندیشمندی در طلبه بوده و نظام آموزشی مبتنی بر پرسش و اندیشه، تعالی یافته‌تر و موفق‌تر و عمیق‌تر از نظام‌های آموزشی حافظه محور است.