تخمه هندوانه طعم بی نظیر و خاصی دارد.تخمه هندوانه مملو از پروتئین، منیزیم، ویتامین B و اسیدهای چرب غیر اشباع و غیر اشباع هستند همه اینها کلسترول را کاهش می دهند، التهاب را کاهش می دهند، و از بیماری قلبی و سکته مغزی جلوگیری می کنند. پروتئین تخمه های هندوانه شامل چندین اسید آمینه است که یکی از آنها آرژنین است ؛ بدن ما مقداری آرژینین تولید می کند، اما آرژنین اضافی دارای مزایای بیشتری است این می تواند فشار خون را تنظیم کند و حتی در درمان بیماری های قلبی عروقی کمک کند. سایر اسید های آمینه در پروتئین تخمه های هندوانه عبارتند از گلوتامیک اسید، تریپتوفان و... می باشد.