ریشه زعفران که به آن خامه زعفران نیز گفته می‌شود، در واقع قسمت سفید رنگ انتهای کلاله‌های زعفران است و با ریشه اصلی گیاه که در خاک قرار دارد و وظیفه تغذیه گل را بر عهده دارد متفاوت است. این بخش به رنگ سفید مایل به زرد است و در هنگام چیدن گل زعفران، همراه با کلاله‌های قرمز رنگ جدا می‌شود.