خاک دیاتومه از بقایای فسیل شده موجودات کوچک آبزی به نام دیاتوم‌ها ساخته شده است. اسکلت آن‌ها از ماده طبیعی به نام سیلیس ساخته شده است. در طی یک دوره زمانی طولانی، دیاتوم‌ها در رسوبات رودخانه‌ها، نهرها، دریاچه‌ها و اقیانوس‌ها انباشته شدند. امروزه ذخایر سیلیس از این مناطق استخراج می‌شود. سیلیس در طبیعت بسیار رایج است و 26 درصد از وزن پوسته زمین را تشکیل می‌دهد. اشکال مختلف سیلیس شامل ماسه، زمرد، کوارتز، فلدسپات، میکا، خاک رس، آزبست و شیشه است. سیلیکون، جزء سیلیکا، به طور طبیعی به شکل خالص وجود ندارد. معمولاً با اکسیژن و آب واکنش داده و دی اکسید سیلیکون تشکیل می‌دهد. دی اکسید سیلیکون دو شکل طبیعی دارد: کریستالی و آمورف. بیشتر دیاتومه‌ها از دی اکسید سیلیکون آمورف ساخته شده اند. با این حال، می‌تواند حاوی سطوح بسیار کم دی اکسید سیلیکون کریستالی باشد. اولین محصولات آفت کش حاوی دی اکسید سیلیکون (زمین دیاتومه) در سال 1960 برای از بین بردن حشرات و کنه‌ها ثبت شد.