کتاب بخارای من، شهر من در حقیقت جلد دوم کتاب مقدمه ای بر تاریخ و فرهنگ نجف آباد است که نویسنده آقای فضل الله خلیلی در شش فصل تالیف کرده است و به آنچه در جلد اول کتاب نپرداخته است، پرداخته. این کتاب نحوه شکل گیری شهر نجف آباد،قبرستان های قدیمی شهر، محلات قدیمی شهر، تصنیف های قدیمی، روایات و اتفاقات تاریخی و مشاهیر، مشاغل و بعضی از طایفه ها که در کتاب اول ذکر نشده است، به تفضیل پرداخته شده است. باشد که با آگاهی از گذشته‌مان آینده خوبی بسازیم.